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给新冠病毒分类机器学习仅需几分钟

字号+作者:redadmin 来源:科技 2020年05月08日

据物理学家组织网28日报道,加拿大估算机科学家和生物学家在当日出版的《科学公共图书馆·概括》杂志撰文指出,他们仰仗机器学习方法,在短短几分钟内对29个不同新冠病毒DNA序列...



        据物理学家组织网28日报道,加拿大估算机科学家和生物学家在当日出版的《科学公共图书馆·概括》杂志撰文指出,他们仰仗机器学习方法,在短短几分钟内对29个不同新冠病毒DNA序列进行分类,断定出一个潜在的“基因签名”。

        他们标明,机器学习这种新的数据发现东西将使科学家能在短短几分钟内快速轻松地对丧身病毒分类,而加快这一进程关于大流行期间医疗资源的战略规划至关重要。此外,最新研讨还支撑一个科学假定——新冠病毒起源于蝙蝠,归于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚型。

        韦仕敦大学生物学教授凯瑟琳·希尔与该校估算机科学、核算与精算科学领域的火伴,及滑铁卢大学估算机科学系的研讨人员一同展开了这项研讨。

        他们指出,这个“超快速、可扩展且高度准确”的分类系统运用新的依据图形的专用软件和决策树方法来说明分类,并从全部或许效果中找出最佳选择。这一机器学习方法可对新冠病毒序列进行100%准确分类,更重要的是,可在数分钟内再次发现5000多个病毒基因组之间最靠近的联络。

        希尔说:“我们需求的是新冠病毒DNA序列能发现自身的内在序列方法,我们运用该签名方法和一种逻辑方法,使该方法与其他病毒尽或许靠近,并在数分钟而非数天、数小时内对新冠病毒进行了非常准确的分类。”

        研讨人员指出,该东西能对任何新发现的新冠病毒或其他病毒序列进行分类,将成为全球大流行期间疫苗和药物开发人员、一线医疗工作者、研讨人员和科学家运用的东西包的重要组成部分。

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